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    質(zhì)粒構(gòu)建的心得分享

    發(fā)布時間: 2024-02-20  點擊次數(shù): 1256次

    質(zhì)粒是我們?nèi)粘嶒炛斜容^常用的載體,其可以自主生長,也能通過比較容易的方法進行大量擴增,但往往單一的質(zhì)粒不能滿足實驗需求,需通過一系列方法進行質(zhì)粒重組,我目前比較常用的方法也就是比較陳舊的酶切重組質(zhì)粒的方式,簡易實驗過程如下圖:

    1708396293214.png

    在這個過程中,有幾個小Tips:

    1.原載體的酶切位點由文獻、載體說明書或者導(dǎo)師建議得來,選擇正確的酶切位點是重組質(zhì)粒開始的第一步,常見的酶切體系如下:

    image.png

    上述體系適用于大多數(shù)酶切,不是特別難切開的載體1μl內(nèi)切酶足夠,酶切前計算好量,先加ddH2O,最后加內(nèi)切酶。


    2.酶切完成后,需要跑瓊脂糖膠鑒定酶切效果,配膠時注意選擇合適的膠濃度,原則是分子量越大,膠濃度越小。跑膠完成后紫外燈下一般會有兩段即為成功:載體和切下來的片段,根據(jù)結(jié)果進行膠回收,注意切下來的片段不回收,膠回收完成后測濃度備用。


    3.插入片段根據(jù)自己的實驗選擇,通常插入片段可以通過PCR而來,或者是一段由三方公司合成的序列,在連接開始前也需要用同樣的兩個內(nèi)切酶切出缺口。常見連接體系如下:


    圖片
    16℃連接4h以上或過夜。

    其中,加入載體和插入片段的量由說明書得來,加樣前計算好量,先加ddH2O,最后加連接酶,由于連接體系較小,一般使用pcr管進行。

    4、為確保連接的順利進行,務(wù)必保證連接酶和連接酶緩沖液配套使用,即使用同一廠家的,不能混用。

    5、上述過程中涉及到的不管是內(nèi)切酶還是連接酶,都是比較昂貴的,使用時要用冰盒,用完及時放回-20℃冰箱。
    6、進行轉(zhuǎn)化時,根據(jù)載體說明書選擇合適的感受肽細胞,同時仔細閱讀感受肽細胞說明書,看清涂板體積、涂板后的培養(yǎng)時間、培養(yǎng)溫度等。
    7、挑取單克隆時,推薦至少選擇兩個及以上。
    8、搖菌時,注意擰松菌管的蓋子,傾斜放入恒溫(一般為37℃)搖床,搖菌時間12-16h為宜。
    9、搖菌完成后進行質(zhì)粒提取,測濃度后送測序,注意這里會有部分說明書推薦選擇新的內(nèi)切酶酶切后跑瓊脂糖膠進行鑒定,這也是一種鑒定方式,可以根據(jù)酶切片段的大小來判斷重組是否正確,但是,最終確定還是推薦進行測序,因為我們無法保證在整個過程中堿基不會發(fā)生突變,可以根據(jù)上述方式選擇酶切片段大小正確的質(zhì)粒進行測序。

    測序的準(zhǔn)確性對于后續(xù)慢病毒感染是非常重要的,因此測序公司的選擇十分重要,尤其出現(xiàn)一些比較難測的結(jié)構(gòu)如shRNA的發(fā)卡結(jié)構(gòu)等,測序技術(shù)不成熟的話會一直報重疊峰或者測不通的情況。

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