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    Trizol法提取RNA:從樣本前處理到操作步驟

    發布時間: 2024-02-28  點擊次數: 1613次

    一、實驗原理:

    Trizol試劑的主要成分是苯酚,對細胞進行裂解,使細胞中的蛋白質以及核酸物質解聚。苯酚雖然可以有效的使蛋白質變性,但它不能全部抑制RNA酶的活性,因此Trizol中還加入了8-羥基喹啉、異硫氰酸胍、β-巰基乙醇等來抑制內源和外源RNase(即RNA酶)。存放在Trizol 中的樣品可以在負八十保存半年左右。


    二、樣本材料及其處理方法:

    貼壁培養細胞

    1.吸出培養液,細胞用預冷的1×PBS清洗兩次。2. 吸出PBS洗液,然后每1×108-2×107的培養細胞中加入1 ml的Trizol,輕搖培養皿,確保溶液均勻分布于細胞表面。(可用細胞刮刀剝離細胞)


    2.吸出PBS洗液,然后每1×108-2×107的培養細胞中加入1 ml的Trizol,輕搖培養皿,確保溶液均勻分布于細胞表面。(可用細胞刮刀剝離細胞)


    3. 使用移液器反復吹打使細胞脫落,然后將內含細胞的裂解液轉移至離心管中,再用移液器吹打直至裂解液中無明顯沉淀(溶液清亮)。


    4. 室溫靜置5-10分鐘后,再進行后續的RNA提取操作。


    懸浮培養細胞

    1. 將懸浮細胞收集至離心管中,12000 rpm 4℃離心2分鐘,棄上清,用預冷的1×PBS清洗兩次。

    2. 向1×106-2×107細胞中加入1ml的Trizol。

    3. 用移液器吹打至裂解液清亮無明顯沉淀。

    4. 室溫靜置5-10分鐘后,再進行后續的RNA提取操作。


    動物組織、植物材料樣品

    1. 將準確稱取的RNA提取樣品轉移液氮預冷的研缽中,用研杵研磨組織(研磨過程中需要不斷向研缽中補加液氮),直至研磨成粉末狀,然后向粉末中加入適量的Trizol并混勻。(針對柔軟易裂解的組織樣本,可以使用勻漿器加入適量Trizol進行勻漿裂解。)


    2. 將上述混合液轉移至離心管中,用移液器反復吹打充分混勻。室溫靜置5分鐘,12,000 rpm 4℃離心5-10分鐘。


    3. 小心吸取上清液,移入新的離心管中,再進行后續的RNA提取操作。


    三、操作步驟:

    (1)樣本前處理

    (2)向上述裂解液中加入Trizol體積量1/5氯仿,充分混合(渦旋或用槍頭混勻)。室溫靜置15分鐘。

    (3)12000 rpm 4℃離心15分鐘。小心取出離心管,此時勻漿液分為三層,即:上清液(含RNA)、中間蛋白層及下層有機相。吸取上清液轉移至另新的離心管中。

    注:每管大概取 200-300 μl,此步驟非常關鍵,提出的RNA質量好純度高即可。若吸取水相時吸到有機相會導致雙峰,A260/230特別低。

    (4)沉淀 RNA:向其中加入相同體積異丙醇,上下顛倒混勻。在-20℃放置10 min。12000 rpm 4℃離心10 min后棄去上清。

    (5)清洗 RNA:向沉淀中加入500 μl 預冷的無水乙醇,吹散沉淀洗滌RNA,洗滌兩次,12000 rpm 4℃離心后棄去上清。

    注:把沉淀彈起來,讓其懸浮在酒精中,然后放1-2min,讓酒精充分接觸沉淀,充分溶解有機試劑,然后再離心。

    (6)打開離心管,室溫干燥沉淀約5分鐘。

    注:不要離心干燥,否則RNA將很難溶解,如果殘留乙醇較多可延長干燥時間。

    (7)向離心管中加入20 μl DPEC水溶解RNA。將溶解后的RNA放入-80℃保存。

    注:如果提取的是組織樣本,溶解液可以多加點。

    (8)取2 μl進行電泳。

    四、注意事項:

    1. 防止RNA酶污染。

    • 戴好口罩,手套。
    • 全程最好在生物安全柜操作(根據實驗條件)
    • 實驗所涉及的試劑/溶液,尤其是水,必須確保RNase-Free。耗材均需要通過DPEC處理。

    2. 明確目標。

    • 提取成功標準是RNA的質量和純度,而不是得率。

    3. 測量結果:

    • A260/A280:1.8-2.2,若<1.8則表明有蛋白質污染;

    • A260/A230:1.5-2.4,若<1.5則表明有明顯的有機物如糖、膚、苯酚的污染。

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